در سایتهای مختلفی که به نقد قرآن می پردازند یکی از شبهاتی که به قرآن وارد می شود آیه 86سوره کهف است و این شببه مطرح می شود چون در قرآن ذکر شده است که خورشید در چشمه گل تیره فرو می رود این آیه از دیدگاه علمی باطل است.
حَتَّى إِذَا بَلَغَ مَغْرِبَ الشَّمْسِ وَجَدَهَا تَغْرُبُ فِی عَیْنٍ حَمِئَةٍ وَوَجَدَ عِندَهَا قَوْمًا قُلْنَا یَا ذَا الْقَرْنَیْنِ إِمَّا أَن تُعَذِّبَ وَإِمَّا أَن تَتَّخِذَ فِیهِمْ حُسْنًا ﴿۸۶﴾
تا آنگاه که به غروبگاه خورشید رسید به نظرش آمد که [خورشید] در چشمهاى گلآلود و سیاه غروب مىکند و نزدیک آن طایفهاى را یافت فرمودیم اى ذوالقرنین [اختیار با توست] یا عذاب مىکنى یا در میانشان [روش] نیکویى پیش مىگیرى (۸۶)
در حالی که اگر به اندکی به این موضوع ژرف تر نگریسته شود این آیه یکی از قوی ترین آیات علمی قرآن است.
توضیح علمی این آیه این است : همانطور که می دانید خورشید یک ستاره است و همه ستاره شناسان می دانند که ستاره ها از گرد و غبار و گاز تشکیل می شند.چهار تصویر زیر مربوط به چهار منطقه شکل گیری ستاره ها در کیهان هستند.
تصویر اول مربوط به سحابی عقاب در فاصله 7000 سال نوری زمین است.قسمت های آبی رنگ ستاره های جوان و داغی هستند که در این سحابی توسط گرد و غبار احاطه شده اند.

در ترجمه انگلیسی تصویر دوم نوشته شده است که تصویر مربوط به ناحیه ستاره سازی N11B در فاصله 16000 سال نور زمین است ابرهای تاریک گرد و غبار و ستاره های جوان داغ در تصویر دیده می شوند.باز در تصویر ستاره های جوانی را به رنگ آبی می بینیم که با گرد و غبار آمیخته شده اند.

تصویر سوم مربوط به منطقه شکل گیری ستاره ها تحت نام N90 در فاصله 200000 سال نوری زمین است که توسط هابل گرفته شده است و ستاره هایی که با گرد و غبار آمیخته هستند در تصویر دیده می شوند.

تصویر چهارم مربوط به سحابی سحابی IC 405 در فاصله 1500 سال نوری زمین است در مرکز تصویر ستاره های آبی رنگ به خوبی دیده می شوند که توسط یک دریایی از گردو غبار به خوبی احاطه شده اند.

در آیه بالا ذوالقرنین موفق به مشاهده یک ناحیه دیگر در فضا و ستارگانی شده بود که در آنجا فرآیند ستاره سازی بسیار شدید است.در سحابی هایی که در آنها ستاره سازی انجام می شود گرد و غبار فراوان وجود دارد و این گرد غبار در کل سحابی با ستاره ها نیز آمیخته می شود و دلیل علمی این آیه این موضوع است.